St. Jude儿童研究医院癌症幸存者平台数千名临床与基因组资讯 免费提供优质资料分析
St. Jude 儿童研究医院(St. Jude Children’s Research Hospital )的研究人员宣布推出首个儿童癌症存活资料共享及分析平台。该平台整合了有关全基因组定序、治疗暴露及治疗结果的资料,建立了首个涵盖来自 7,700 多名癌症儿童幸存者 4 亿份基因变异资料的研究系统。
该平台属于 St. Jude Cloud 系统,免费向公众开放使用。过去 61 年间,St. Jude 所进行的研究对提高儿童癌症存活率具有重要意义。如今,美国癌症患儿确诊后的五年存活率约为 85%。
虽然癌症幸存者越来越多,但他们仍面临一系列与癌症或癌症治疗相关的健康问题,例如早逝、器官功能障碍、继发性癌症、社会心理挑战等。透过研究儿童癌症幸存者这个特殊族群,研究人员可了解如何为癌症患儿制定合适的治疗方案,并在后续提供定期筛检与支持,避免造成不良后果。
文章共同作者、St. Jude 计算生物学部门的 Jinghui Zhang 张尽晖博士表示:「使用者只需轻松点击一下,就能在这个平台上获得新发现。」她还指出:「在过去,下载、分析、整理、总结资料可能要耗费数周时间,而现在只需几分钟就能完成。」
基于该平台资料取得的新发现包括:
●从数十年前开始,铂金类化疗就被用于癌症治疗,且目前已知此类化疗会造成听力损伤。但该平台的资料显示,并非所有类型的铂金类化疗都会造成相同程度的伤害。
●基因突变与非裔癌症幸存者日后罹患心脏病的机率增加有关。
●心理健康、年龄与截肢之间发现了新的关联:截肢时年龄较大(即青少年时期而非儿童时期)的患者能更好地应对心理健康问题。
来自 St. Jude 计算生物学部门的周鑫博士称:「该平台拥有五亿个临床资料点,上百兆位元组的基因资料,并且还提供了动态互动式可视化分析功能。」
「我们所做的不仅是分享资料,」St. Jude 流行病与癌症控制部门的 Yutaka Yasui 博士表示,「更是在促进资料分析与资料可视化,让所有人都可以免费使用。对于癌症幸存者而言,这是非常宝贵的资源。」
美国每年确诊儿童癌症的人数约 15,000人,其中最常见的癌症包括白血病、淋巴瘤和脑瘤。然而,儿童癌症的类型远不止于此,总共有超过 100 种。
St. Jude 由黎巴嫩二代移民丹尼·托马斯 (Denny Thomas)于 1962 年在田纳西州的曼菲斯成立,为全球罹患重病的儿童提供医疗服务,无论他们的种族、民族、信仰或财力如何。今年 10 月,St. Jude Children’s Research Hospital 连续第 17 年获《美国新闻与世界报道》评为「美国十大儿童医院」。
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